Fundacją "Dzieło Nowego Tysiąclecia" kierują:

Rada Fundacji:

• Ks. Abp Kazimierz Nycz - Przewodniczący
• Ks. Abp Tadeusz Gocłowski - Wiceprzewodniczący
• Ks. Abp Henryk Hoser
• Ks. Bp Marek Mendyk
• Prof. Dr Hab. Zbigniew Cieślak
• Piotr Gaweł
• O. Andrzej Majewski SJ
• Prof. Dr Hab. Jerzy Olędzki
• Mec. Michał Rościszewski
• Ks. Tomasz Sielicki
• Adam Tański
• Ks. Henryk Zieliński

Zarząd Fundacji:

• Ks. Prał. Jan Drob - Przewodniczący
  
• Andrzej Cehak - Wiceprzewodniczący
  
• Ks. Dariusz Kowalczyk - Członek
  
• Marek Zdrojewski - Członek